生活废水基本控制项目：COD、BOD₅、悬浮物、动植物油、石油类、阴离子表面活性剂、总氮（以N计）、氨氮（以N计）、总磷（以P计）、色度、pH、粪大肠菌群数、总汞、烷基汞、总镉、总铬、六价铬、总砷、 总铅
选择性控制项目：总镍、总铍、总银、总铜、总锌、总锰、总硒、苯并（a）芘、挥发酚、总氰化物、硫化物、甲醛、苯胺类、总硝基化合物、有机磷农药（以P计）、马拉硫磷、乐果、对硫磷、甲基对硫磷、五氯酚、三氯甲烷、四氯化碳、三氯乙烯、四氯乙烯 、苯、甲苯、邻-二甲苯、对-二甲苯、间-二甲苯、乙苯、氯苯、1,4-二氯苯、1,2-二氯苯、对硝基氯苯、苯酚、间-甲酚、2,4-二氯酚、2,4,6-三氯酚、邻苯二甲酸二丁酯、邻苯二甲酸二辛酯、丙烯腈、可吸附有机卤化物（AOX以Cl计）

工业废水第一类污染物：总汞、烷基汞、总镉、总铬、六价铬、总砷、总铅、总镍、苯并（a）芘、总铍、总银、总α放射性、总β放射性
第二类污染物：pH、色度、悬浮物、BOD₅、COD、石油类、动植物油、挥发酚、总氰化物、硫化物、氨氮、氟化物、磷酸盐（以P计）、甲醛、苯胺类、硝基苯类、阴离子表面活性剂、总铜、总锌、总锰、元素磷、有机磷（以P计）、农药、粪大肠菌群等

地表水必测项目：水温、pH、溶解氧、高锰酸盐指数、化学需氧量、BOD、氨氮、总氮、总磷、铜、锌、氟化物、挥发酚、石油类、阴离子表面活性剂、硫化物和粪大肠菌群、硒、砷、汞、镉、汞、铬（六价）、铅、氰化物等
选测项目：总有机碳、甲基汞、硝酸盐、亚硝酸盐等

底泥1、底质监测必测项目：砷、汞、烷基汞、铬、六价铬、铅、镉、铜、锌、硫化物和有机质选测项目：有机氯农药、有机磷农药、除草剂、PCBs、烷基汞、苯系物、多环芳烃和邻苯二甲酸酯类
2、污泥监测项目：污水处理设施的污泥或纳入污水河渠和水域的污泥监测项

医疗废水粪大肠菌群数、肠道致病菌、肠道病毒、结核杆菌、pH、COD、BOD、悬浮物、氨氮、动植物油、石油类、阴离子表面活性剂、色度、挥发酚、总氰化物、总汞、总镉、总铬、六价铬、总砷、总铅、总银、总α、总β、总余氯

地下水常规指标（39项）：感官改善及一般化学指标（20项）、微生物指标（2项）、毒理学指标（15项）、放射性指标（2项）
非常规指标（54项）
毒理学指标（54项）

工业循环水pH、悬浮物、总铁、化学需氧量、浊度、总硬度、总碱度、氨态氮、硫化物、油含量、总磷、溶解性固体、五日生化需氧量、细菌总数、钾、钠、军团菌等